Yugi mora com seu avô, dono da loja de jogos Kame Solomon Muto. Ele adora todos os jogos, seu maior tesouro é uma misteriosa caixa com os dizeres: “algo que você vê, mas nunca viu”, o conhecido Enigma do Milênio capaz de realizar qualquer desejo a quem lhe desvendar. Yugi já sabe exatamente o que pedir: um grande amigo que nunca lhe traia e ao qual ele nunca o trairá. O problema é que o colégio de Yugi está cheio de encrenqueiros dispostos a infernizar a vida do garoto, a vítima perfeita para as mais variadas brincadeiras dos coleguinhas, principalmente de Tristan e Joey. Mas algo está prestes a mudar…